An der Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, Medizinische Fakultät, AG (Bio-)Medical Data Science ist folgende wissenschaftliche Stelle zu besetzen

Postdoc / Senior für (Bio-) Medical Data Science – Bioinformatik – KI (inkl. Co-Leitung für Arbeitsgruppe) (m-w-d)

Vergütung: nach Aufgabenübertragung und Erfüllung der persönlichen Voraussetzungen bis zur Entgeltgruppe 13 TV-L (100 %), bei Übernahme entsprechender Leitungsverantwortung auch späterer Wechsel zu E14 möglich; Teilzeitbeschäftigung und Home Office teilweise möglich

Startdatum: zum nächstmöglichen Zeitpunkt

zunächst auf 3 Jahre befristet

Referenznummer: 7-016/24-D (Bewerbungsfrist: 17.04.2024, formeller Ausschreibungstext hier: https://www.verwaltung.uni-halle.de/dezern3/Ausschr/24_7_016_24_D.pdf )

Die Arbeitsgruppe (Bio-)Medical Data Science an der Universitätsmedizin Halle forscht & wirkt als wissenschaftlicher Arm des Datenintegrationszentrums (DIZ) und in enger Verbundenheit mit dem Institut für Medizinische Epidemiologie, Biometrie und Informatik (IMEBI) sowie dem Krukenberg-Krebszentrum mit Beteiligung an der Medizininformatik-Initiative in folgenden Bereichen:

• IT-Infrastrukturen für die Forschung, insbesondere im Hinblick für das Molekulare Tumorboard und die Visualisierung von Daten in translationalen Forschungsplattformen
• Integration und Evaluation von KI in klinische(n) Prozessen
• Forschungsdatenmanagment

Dabei liegt unser Fokus nicht auf theoretischen Konstrukten, sondern auf der tatsächlichen Verbesserung von Prozessen. Wir verstehen uns als forschende Dienstleister, die aufgrund ihrer IT-Kompetenzen Optimierungspotential in möglichst vielen Bereichen der Universitätsmedizin erkennen und engagiert durch z.B. KI/LLMs, automatische Analyse-Pipelines, Dashboards oder automatisierte Datenflüsse heben sowie dabei wissenschaftlich begleiten und publizieren.

Wir wollen Klinikern und Forschern ihre Arbeit erleichtern bzw. deren (z.B. auch durch klinische Entscheidungsunterstützung (CDS) Effizienz verbessern und damit mittelbar auch für Patienten einen Unterschied machen. Dabei pflegen wir einen pragmatischen und teamorientierten Ansatz, der sich utilitaristisch an übergeordneten Zielen orientiert.

• Wissenschaftliche Arbeit in den Bereichen IT-Infrastrukturen für die Forschung (maßgeblich auch für das Molekulare Tumorboard), datenanalytischer Tools sowie Einsatz & Evaluation von KI in der klinischen Versorgung & Forschung
• Konzeption und Entwicklung von Pipelines zur Datenintegration und –analyse
• Konzeption und Entwicklung von interaktiven Dashboards, Visualisierungen für translationale Forschungsplattformen und Einbettung von Komponenten ins Front- oder Backend
• Beteiligung an der Lehre im Bereich von Data Science
• Beteiligung am Projektmanagement und der Führung eines Teams

Notwendig:

• eine engagierte Persönlichkeit mit Promotion (mindestens magna cum laude) im naturwissenschaftlich oder informationstechnischen Bereich, welche sowohl technisch tatkräftig mit anpacken als sich auch an der Leitung der AG beteiligen möchte.
• Kompetenz und Erfahrung im bioinformatischen / molekularbiologischen Bereich (idealerweise im Spannungsfeld von den molekularbiologischen Analysen bis zu den sich daraus ergebenden IT unterstützten Therapieempfehlung für Tumorpatienten, vgl. PM4Onco, ZPM, DNPM, Modellvorhaben Genomsequenzierung, GenomDE etc.).
• Interesse an der Begleitung von (bio-)informatischen studentischen Abschlussarbeiten, Promotionen, Publikationen und Anträgen
• Sprachkenntnisse: Deutsch mindestens C1, englisch mindestens B2.
• Intrinsische Motivation, die Welt besser und die Mitmenschen glücklich machen zu wollen.

Als eierlegende Wollmilchsau dazu:

• Erfahrungen mit Linux (und idealerweise Dockeranwendungen)
• Erfahrung im Umgang mit komplexen Datensätzen und Datenbanken (SQL, NoSQL)
• Erfahrung in der Entwicklung (design, prototyping und deployment) von Dashboards (R Shiny oder Plotly Dash), sowie im Umgang mit git und bash
• Kenntnisse in Machine Learning sowie einer Programmiersprache zur Datenanalyse (z.B. R oder Python)

• ein konstruktives 5-10 köpfiges Team im Verbund mit dem Datenintegrationszentrum sowie dem IMEBI.
• spannende lebensnahe und in der Praxis nützliche Projekte, die wir zu einem guten Stück selbst (mit)gestalten können.
• eine (insbesondere für Universitäten) moderne technische Ausstattung und kollegiale Führung.
• partielles Home-Office und Option auf Teilzeit bis zu 60%.
• Möglichkeit zur Habilitation bzw. in der Postdoc-Zeit sich weiter zu entwickeln, um anschließend den akademischen Weg weiter oder in die Wirtschaft zu gehen.
• Gehalt beginnend bei E13 mit der Möglichkeit bei Übernahme entsprechender Leitungsverantwortung auf E14 zu wechseln.